Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc3Q9D6Y1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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