Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms