Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stag1Q9D3E6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms