Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy3Q9D394 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms