Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms