Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ube2fQ9CY34 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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