Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RpainQ9CWY9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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RpainQ9CWY9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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RpainQ9CWY9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms