Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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