Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms