Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms