Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rab5aQ9CQD1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rab5aQ9CQD1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rab5aQ9CQD1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab5aQ9CQD1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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