Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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