Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Commd4Q9CQ02 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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