Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b1Q99NB9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms