Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ms4a8Q99N10 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ms4a8Q99N10 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ms4a8Q99N10 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ms4a8Q99N10 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ms4a8Q99N10 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ms4a8Q99N10 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a8Q99N10 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ms4a8Q99N10 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms