Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms