Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp3Q99JB6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp3Q99JB6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp3Q99JB6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp3Q99JB6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp3Q99JB6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp3Q99JB6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp3Q99JB6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp3Q99JB6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp3Q99JB6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxp3Q99JB6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms