Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Smim11aQ99J19 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smim11aQ99J19 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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