Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EP400Q96L91 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EP400Q96L91 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms