Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms