Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms