Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms