Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lims2Q91XD2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms