Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmcd1Q8VEE1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmcd1Q8VEE1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms