Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms