Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fcho1Q8K285 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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