Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp27Q8CEG8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms