Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms