Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpped1Q8BFS6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms