Protein–RNA interactions for Protein: Q810U4

Nrcam, Neuronal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrcamQ810U4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NrcamQ810U4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrcamQ810U4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms