Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim19Q80ZU4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms