Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf8Q80TJ7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms