Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms