Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrn2Q6PHP6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn2Q6PHP6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms