Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtifQ6PEE2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms