Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp49Q6P9L4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms