Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgb4Q6P8W9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms