Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smchd1Q6P5D8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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