Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpbp1Q6NXH3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpbp1Q6NXH3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms