Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca2Q6DIC0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms