Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nop58Q6DFW4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nop58Q6DFW4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms