Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms