Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tbr1Q64336 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tbr1Q64336 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tbr1Q64336 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tbr1Q64336 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tbr1Q64336 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tbr1Q64336 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tbr1Q64336 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tbr1Q64336 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tbr1Q64336 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tbr1Q64336 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbr1Q64336 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tbr1Q64336 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tbr1Q64336 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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