Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tfe3Q64092 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfe3Q64092 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfe3Q64092 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfe3Q64092 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfe3Q64092 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfe3Q64092 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfe3Q64092 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfe3Q64092 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfe3Q64092 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfe3Q64092 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfe3Q64092 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfe3Q64092 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfe3Q64092 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Tfe3Q64092 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Tfe3Q64092 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Tfe3Q64092 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Tfe3Q64092 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Tfe3Q64092 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Tfe3Q64092 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tfe3Q64092 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfe3Q64092 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms