Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vil1Q62468 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms