Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sema5aQ62217 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sema5aQ62217 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema5aQ62217 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sema5aQ62217 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sema5aQ62217 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sema5aQ62217 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Sema5aQ62217 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Sema5aQ62217 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sema5aQ62217 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sema5aQ62217 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sema5aQ62217 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sema5aQ62217 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms