Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim25Q61510 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim25Q61510 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim25Q61510 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim25Q61510 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim25Q61510 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim25Q61510 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim25Q61510 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim25Q61510 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms