Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samhd1Q60710 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samhd1Q60710 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms