Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms