Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trim58Q5NCC9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim58Q5NCC9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms